頂級期刊中的定量蛋白質組學進展—TMT標記的技術進展和臨床應用


2020年04月16日 01:30

2020年04月16日 03:00

朱洪文,李嘉銘

生命科學  


內容簡介

TMT定量的技術進展? Nature Methods一作向您娓娓道來

多組學數據的整合分析? Cell一作為您撥云見日

【報告日程

時間 報告人 單位 報告題目
09:30-10:15 李嘉銘 哈佛大學醫學院 《新一代串聯質譜標簽系統(TMTpro)實現16通道蛋白質組定量分析》
10:15-11:00 朱洪文 中國科學院上海藥物研究所 《多標TMT技術在腫瘤蛋白基因組學研究中的應用》

【報告簡介】

《新一代串聯質譜標簽系統(TMTpro)實現16通道蛋白質組定量分析》

蛋白質組學對生物體內的所有蛋白質進行定性和定量分析。經過近年蛋白質組學技術不斷發展,其在生物問題研究和藥物研發等多方面都起著非常重要的作用。目前蛋白質組學技術仍面臨三個主要挑戰:分析速度,蛋白質組覆蓋深度,以及定量分析的質量。

串聯質譜標簽系統(TMT)可以在一次實驗中對多個樣品在全蛋白質組水平同時進行定量分析,是應對以上三個挑戰非常有效的策略。經過多年的發展,TMT標記試劑從最初的6通道已發展到11通道,但受其結構限制已經無法繼續增加通量。新一代串聯質譜標簽系統(TMTpro)具有重新設計的質量平衡基團和新的基于脯氨酸的報告離子基團,理論上最多可以提供18通道標記。在本報告中作者將主要介紹16通道TMTpro標記試劑的應用,以及近年針對串聯質譜標簽系統的一些技術優化。

串聯質譜標記系統從11通道增加到16通道不僅僅是增加通量,降低分析時間。基于16通道TMTpro標記試劑的策略代表了一個封閉的系統,在這個系統之內每個蛋白質可以在樣品間無缺失值的被準確定量,并且16通道的實現允許了更加靈活和復雜的實驗設計。TMTpro將會進一步推動定量蛋白質組學技術到達更高的通量和覆蓋深度。

《多標TMT技術在腫瘤蛋白基因組學研究中的應用》

腫瘤生物學指研究腫瘤發生發展的分子機制以及腫瘤防治的生物科學。近些年來,隨著質譜技術的發展,蛋白質組學方法在腫瘤研究中的應用越來越廣,尤其是以蛋白質組學為核心的多組學分析是現在臨床腫瘤大樣本研究的熱點。多標TMT技術可以實現多個腫瘤樣本的同時分析,與肽段分級方法聯用可以實現腫瘤蛋白質組的深度覆蓋,進一步聯合磷酸化富集方法可以實現磷酸化蛋白質組的深度鑒定和定量。我們利用TMT11標方法,對159例感染HBV的中國肝細胞癌病人的癌組織和配對癌旁肝組織樣本,進行了大規模蛋白質組和磷酸化蛋白質組分析,進一步整合基因突變、拷貝數變異、基因表達譜等信息,探究了肝癌腫瘤細胞的分子特征,全面解析了肝癌的發生和發展機制,為肝癌的精準分型與個體化治療、療效監測和預后判斷提供了新的思路和策略。


主講人簡介

朱洪文

博士,2017年1月畢業于中科院生化細胞所,師從曾嶸研究員。2017年2月至2020年3月,在中科院上海藥物研究所從事博士后研究。長期從事液相色譜-質譜聯用和定量蛋白質組學相關技術和應用研究,迄今已經在Cell、Acta Pharm. Sin. B、IScience、Cancer letters等發表論文18篇。

李嘉銘

博士,2016年畢業于中科院上海生化細胞所,師從曾嶸研究員,主要從事蛋白質組學技術和應用研究。隨后在麻省理工學院進行為期一年的博士后訓練。在2017年5月加入哈佛大學醫學院Steven P. Gygi實驗室進行博士后訓練,主要從事基于串聯質譜標簽系統的蛋白質組學技術和應用研究。

我要參會

Webinar分析測試百科網

QQ群號:254280557

更多 科研矩陣
Antpedia 生物醫藥群
Antpedia 生物醫藥群

218/500 加入群

加入群
Antpedia 材料化工群

103/500

加入群
Antpedia 環境能源群

75/500

加入群
Antpedia 食品安全群

83/500

加入群
Antpedia 前處理分析群

58/500

加入群
Antpedia 質譜群

343/500

lol赛事下注